Paimionjoki saa alkunsa Somerniemeltä 30 kilometrin mittaisella järviketjulla. Someron, Kosken, Marttilan ja Tarvasjoen kautta 104 kilmetriä pitkä joki kulkee läpi Paimion laskien vetensä Paimionlahteen.

Paimionjokilaakso on luokiteltu valtakunnallisesti merkittäväksi maisema-alueeksi sekä valtakunnallisesti merkittäksi kulttuurihistorialliseksi ympäristöksi.